影片将会有两条故事线，一边是以凯德·伊格尔（马克·沃尔伯格 饰）为主的人类，将与恐龙金刚一起面对即将到来的新威胁；另一边是擎天柱在太空中搜寻其统治者“五面怪”，也是它派赏金猎人“禁闭”四处搜捕领袖，而擎天柱将在途中遭遇超级反派“宇宙大帝”。