经过上百万年的进化，熊猫一族经历了无数艰难险阻，走到今天。虽然濒临灭绝的熊猫接受了人类的细心呵护，但是一场史无前例的灾难即将席卷它们的栖息地，狂风暴雨会引发洪水，毁灭熊猫一族。担心子孙的命运，祖先们向熊猫菩萨（赵忠祥 配音）请教，菩萨预言将有一只继承了祖先们智慧的超级熊猫降生，拯救本民族的命运。

与此同时，森林中名叫潘迪（何炅 配音）的小熊猫诞生，此时此刻他还并不知晓自己所肩负的使命。调皮顽劣的潘迪惹出不少的麻烦，也经历了诸多的考验，同时结交了许多的好朋友。在祖先之一（李扬 配音）的冥冥指引下，潘迪逐渐担当起本族未来的重任……