《顽皮鬼3》的故事发生在前两部之后，杰森·李饰演的电脑黑客再次卷入一场高科技犯罪。这一次，他与凯文·史派西饰演的富商联手，试图阻止一个国际犯罪集团的阴谋。影片中，两人利用各自的技能和智慧，展开了一系列啼笑皆非的冒险。

在一系列的追逐和对决中，他们不仅揭露了犯罪集团的真面目，还意外地修复了彼此之间的关系。最终，正义得以伸张，而两人也找到了新的合作机会。