故事发生在东京秋叶原，主角们是高中生，他们对虚拟世界充满好奇。一天，他们意外发现了一个隐藏的虚拟世界入口，进入后发现了一个与现实世界紧密相连的秘密。随着调查的深入，他们发现了一个涉及科技巨头和政府的秘密组织，该组织试图利用虚拟世界控制现实世界。

主角们必须解开谜团，同时面对来自组织的威胁。在一系列惊心动魄的冒险后，他们最终揭露了真相，并阻止了一场可能改变世界的大灾难。