续集从潘多拉星球的地下开始，展现了纳美人与人类之间的紧张关系。杰克·萨利和奈蒂莉继续领导纳美人对抗人类的开采活动。为了保护家园，纳美人展开了一系列反击行动。杰克深入地下，发现了一个关于潘多拉星球起源的秘密，这个秘密可能改变整个星球的命运。

同时，人类军队也在加强攻势，一场决定潘多拉星球未来的战争一触即发。