1926年，纽特·斯卡曼德带着他的神奇动物前往纽约，但很快他的箱子中的神奇动物开始逃逸。

与此同时，美国魔法部的年轻巫师蒂娜·戈德斯坦和她的兄弟卢克发现了纽特的箱子，误以为箱中的动物是危险的。为了保护这些神奇动物，纽特与蒂娜联手，对抗试图捕捉这些动物的黑巫师盖勒特·格林德沃。在寻找并保护神奇动物的过程中，纽特和蒂娜之间产生了深厚的情感纽带。