电影开始于拉鲁斯和吉吉在海上发现了一座传说中的天空之城拉普达。他们被卷入了一场争夺拉普达宝藏的斗争中，同时也在寻找拉普达的真相。途中他们遇到了机器人拉普达的守护者，与之成为了朋友。