故事发生在清朝年间，百胜堂掌门人李承言（张译饰）医术高超，深受百姓爱戴。朝廷权贵试图通过各种手段控制百胜堂，以垄断药材资源。李承言联合王凯饰演的医术高超的同门师弟和赵丽颖饰演的医馆女掌柜，共同对抗权贵，保护百姓健康。

在一系列斗智斗勇的事件中，三人逐渐产生了深厚的情谊。最终，他们成功揭露了权贵的阴谋，保护了百胜堂的独立性。