第一季主要讲述了四名、芬恩·伍德卢普、杰克·朗、杰克森·马丁内斯四位主角如何从普通青少年成长为忍者神龟的过程。他们与导师斯普林斯汀、变种人敌人以及纽约市的犯罪组织斗争，保护城市免受威胁。