近未来，由于温室效应日益严重，海平面逐年上升，许多城市乃至国家沉入海底，由此导致人类社会的衰退和人口锐减。放眼望去，仅存陆地上遍布废墟与残骸。仿佛倒退了几百年光阴似的文明硕果，安安静静地繁衍生息。

在三浦半岛西边海岬附近，坐落着一间孤零零的小咖啡店。店主人十年前离开此地，只留下美丽的人形机器人初濑野阿尔亚（椎名へきる 配音）看守小店。十年亦如一日，阿尔亚耐心等待主人的归来。这一天，与她容貌极其相似的女孩（中川亚纪子 配音）出现，她是A7M3型机器人。

女孩带来了阿尔亚期盼已久的主人的消息…… 本片根据芦奈野ひとし的同名原作改编。