2013年的暑假，柯南一行人前往远海酒店度假。在酒店内，柯南发现了一张神秘的纸条，上面写着“13:13”。柯南决定调查此事，却发现酒店内发生了多起离奇案件。柯南与灰原哀、服部平次等人联手，逐步揭开案件背后的真相。

原来，这一切与酒店内部的一场密室杀人案有关，凶手为了掩盖真相，制造了一系列假象。柯南通过仔细观察和推理，最终揭露了真凶，并解救了被囚禁的受害者。